ในยาเม็ดคุมกำเนิดฉุกเฉิน จะมีตัวยาที่เป็นฮฮร์โมน ซึ่งมีกลไกการป้องกันการตั้งครรภ์ต่างๆ ทำให้ยับยั้งการตกไข่ ผลทำให้ไม่มีการตกไข่ หรือ ตกช้าออกไป ทำให้ประจำเดือนรอบนั้น อาจเลื่อนออกไป หรือ กะปริดกะปรอยได้ และมีผลทำให้เยื่อบุโพรงมดลูกไม่พร้อมในการฝังตัว อาจส่งผลให้มีเลือดออกมาจากช่องคลอดได้หลังทาน 3-7 วันครับ ส่วนอาการอื่นๆที่อาจพบได้ เช่น ปวดท้องน้อย คลื่นไส้ แต่มักไม่อาเจียน เป็นต้นครับ ซึ่งอาการต่างๆนี้ จะมีในช่วง 1-3 วันหลังทานเลยครับ แต่อาการต่างๆนี้ ไม่จำเป็นจะต้องมีนะครับ และการที่มีหรือไม่มีก้ไม่ได้เกี่ยวข้องกับผลหรือประสิทธิภาพของยานะครับ

ส่วนหากมีประจำเดือนเลื่อนหรือขาดไปแล้ว ก็ควรตรวจการตั้งครรภ์ทางปัสสาวะนะครับ ซึ่งในช่วงที่ประจำเดือนไม่มาหรือขาดหายไปประมาณ 1 สัปดาห์ ผลที่ได้จะน่าเชื่อถือครับ