ยาคุมฉุกเฉินเป้นฮอร์โมนโปรเจสโตรเจนในชนาดสูง หลังใช้จะมีผลต่อผนังเยื่อบุโพรงมดลูกทำให้ไม่เหมาะต่อการฝังตัวของตัวอ่อน และอาจจะส่งผลกระทบต่อการตกไข่ จึงทำให้มีเลือดออกผิดปกติและอาจจะทำให้รอบเดือนมีความคลาดเคลื่อนออกไปได้ แต่ไม่สามารถตอบได้ว่าจะคลาดเคลื่อนออกไปนานเท่าใด ในกรณีที่รอบเดือนมีความคลาดเคลื่อนอกไปนานหรือเลยกำหนดไปนานสัก 2 สัปดาห์และตรวจปัสสาวะแล้วไม่พบว่ามีการตั้งครรภ์ ก็สามารถใช้ฮอร์โมนเพื่อให้รอบเดือนมาได้ โดยฮอร์โมนที่ใช้อาจจะเป็นโปรเจสโตรเจนหรือยาเม็ดคุมกำเนิด ไม่มีผลข้างเคียงแต่อย่างใด สามารถปรึกษาเภสัชกรหรือแพทย์เพื่อรับฮอร์โมนมาใช้ได้ เมื่อรอบเดือนมาได้เองตามปกติ ในครั้งถัดไปก็ให้สังเกตอาการไปก่อน รอบเดือนน่าจะมาได้เองตามปกติ แต่ถ้ายังไม่ปกติก็ควรปรึกษาแพทย์เพื่อรับฮอร์โมนมาทานต่อได้อีก ไม่มีอันตรายแต่อย่างใด มั้งนี้ ถ้าไม่พร้อมที่จะมีบุตรจะต้องคุมกำเนิดโดยการสวมถุงยางอนามัยระหว่างการใช้ฮอร์โมนในการรักษาตลอด เพราะฮอร์โมนที่ใช้อาจจะทำให้ลูกมีอวัยวะเพศกำกวมได้ค่ะ